据外交部网站，2024年9月23日，外交部副部长孙卫东会见日本外务副大臣柘植芳文，就双边关系和共同关心的问题交换意见。
孙卫东表示，中日两国领导人就致力于构建契合新时代要求的建设性、稳定的中日关系达成重要共识，重新确认全面推进两国战略互惠关系，为两国关系发展指明了方向。希望日方同中方相向而行，恪守中日四个政治文件原则，把两国领导人重要共识落到实处，为两国关系改善发展积累正面因素。
孙卫东就近期日方在美日印澳“四边机制”领导人会议、日美领导人会晤期间涉华消极动向表示严重关切，要求日方在台湾、涉海等问题上谨言慎行，把一个中国原则体现在实际政策和具体行动上，停止在南海问题上对中方指手画脚，不得做南海的搅局者和肇事方。
孙卫东重申中方反对福岛核污染水排海的一贯立场，敦促日方全面完整准确落实中日双边共识，确保对核污染水的长期国际监测和中方独立取样监测得以有效实施。
孙卫东对深圳日本人学校男童遇袭身亡表示遗憾和痛惜，向男童家属表示慰问，强调这是一起孤立的个案，中国是法治国家，一直并将继续采取有效措施，保障所有在华外国公民的安全。